[카테고리:] Research topics

  • Sarcopenia (Aging) Archiving

    Aging-related sarcopenia Reference : Multimodal cell atlas of the ageing human skeletal muscle | Nature Brain-muscle communication prevents muscle aging by maintaining daily physiology | Science Senescent immune cells release grancalcin to promote skeletal aging – ScienceDirect

  • Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis | Nature Methods

    Winnie09/GPTCelltype (github.com) Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis | Nature Methods Introduction 예시 – 면역세포또한 종류가 아주 많은 것을 볼 수 있다. 이를 유전자 발현으로 구분하려면 전문 지식이 필요하다. 예시 – 실제 본인 데이터(Unpublished) Liu et al., BMC Cancer, 2023 말했다시피 굉장히 소모적이고 인간의 노 – 력이 필요하다. 현재 나와있는 자동…

  • [Target Discovery / Novel Target] 회사마다 핵심이 되는 Paper 모음

    Insilico Medicine:A small-molecule TNIK inhibitor targets fibrosis in preclinical and clinical models | Nature Biotechnology Exscientia:문헌에서 타겟탐색Serrano Najera et al 2021.pdf (prismic.io) PheWAS+언어모델로 타겟 우선화Narganes-Carlon et al Sci Rep 2023.pdf (prismic.io) Recursion OS:scRNA, image 로 데이터 모으기Scientific Materials (recursion.com) Owkin:RCT에서 Subgroup 분석방법Subgroup analysis methods for time-to-event outcomes in heterogeneous randomized controlled trials – Owkin 기업 레벨의 약물개발을 위한 연합학습Industry-scale orchestrated federated learning for drug discovery – Owkin Causaly:타겟 안전성Enhance Your Search…

  • [Ideas] Process Engineering and Biology

    JS 와 이야기하면서 나온 아이디어들 Control engineering meets synthetic biology: Foundations and applications – ScienceDirect

  • [LLM] LLM-Biology/Chemistry integration

  • [Mendelian Randomization] Archives

    Two-sample MR – Mendelian randomization dictionary (mrcieu.ac.uk) Commentary: Two-sample Mendelian randomization: opportunities and challenges | International Journal of Epidemiology | Oxford Academic (oup.com) Mendelian randomization: genetic anchors for causal inference in epidemiological studies – PubMed (nih.gov) Prenatal alcohol exposure and offspring cognition and school performance. A ‘Mendelian randomization’ natural experiment – PubMed (nih.gov) Two-sample Mendelian…

  • Constructing a integrated Drug-Target database with direction

    gkac813.pdf (silverchair.com) Using BERT to identify drug-target interactions from whole PubMed | BMC Bioinformatics | Full Text (biomedcentral.com) A sequence labeling framework for extracting drug–protein relations from biomedical literature (silverchair.com)

  • Drug-target interaction methods archive

  • Human Virome Program

    뉴스레터로 받아보고 있는 바이오인의 기사 발췌. … 우리 몸 안의 바이러스는 1013개 이상으로 방대하지만, 질병을 유발하는 적은 수의 바이러스를 제외하면 바이러스에 대한 연구는 거의 이루어지지 않고 있는 상황. 이에 미국 NIH는 인체 바이러스가 건강에 미치는 영향을 이해하기 위해 2024년부터 새로운 Common Fund 프로그램 중 하나로 Human Virome Program(HVP)를 10년간 지원할 계획 … 전염병이 유행하며 바이러스에…